配額是指排放二氧化碳的權(quán)利，每個(gè)配額都授予持有者排放一噸二氧化碳的權(quán)利。在EU ETS的第一階段和第二階段，成員國被授權(quán)在其行業(yè)內(nèi)將配額分配給各個(gè)實(shí)體。各個(gè)成員國需要制定每個(gè)實(shí)施階段的國家分配計(jì)劃（National Allocation Plan,NAP）。歐盟成員國在制定該國家分配計(jì)劃的時(shí)候享有很大的自主權(quán)。國家分配計(jì)劃的主要內(nèi)容包括一個(gè)國家的配額總量，分配方法以及分配到每個(gè)納入實(shí)體的配額等。

由于其特殊的法律和政治背景，歐盟沒有權(quán)利批準(zhǔn)各個(gè)成員國所提交的NAP，但可以審核并且拒絕各個(gè)國家分配計(jì)劃的內(nèi)容。在制定國家分配計(jì)劃的過程中，歐盟扮演的是一個(gè)協(xié)調(diào)和指導(dǎo)性的角色。在第一階段，在如何制定國家分配計(jì)劃方面并沒有官方的指南，歐盟委員會旨在幫助各個(gè)成員國彌補(bǔ)各個(gè)法律機(jī)構(gòu)和利益相關(guān)方之間的知識差距，在ETS的各個(gè)指令中只提供非官方的文件來就國家分配計(jì)劃的制定提供實(shí)際操作步驟，并且提供詳細(xì)指南說明歐盟委員會如何解釋ETS指令下的各個(gè)評估標(biāo)準(zhǔn)。歐盟委員會于2005年12月（歐盟委員會2005c）發(fā)布了針對第二階段的指南文件，并于2006年11月發(fā)布了指南更新文件，旨在對各參與國分配計(jì)劃的制定提供法律性文件（指南）。這兩個(gè)指南以一種在歐盟層面上更加和諧的方式，為各個(gè)成員國制定其國家分配計(jì)劃提供更加直接的指導(dǎo)。