農業(yè)是基礎產業(yè)，同時也是高風險、低產出的行業(yè)，為彌補金融機構提供農業(yè)金融承擔的政策風險和損失，世界各國對農業(yè)金融業(yè)務提供政策補償是普遍的做法。而我國農村金融機構雖然承擔了大部分政策性支農任務，但在財政補貼、稅收優(yōu)惠等方面卻沒有建立相應的補償機制。這不僅加重了農村金融機構的經營負擔，降低了農村金融機構的競爭活力，而且遏止了農村金融的良性發(fā)展。針對農村地區(qū)開辦金融業(yè)務風險多、自然災害影響大、農民收入低、還款能力弱等問題，我國應建立健全涉農貸款風險補償機制。一是盡快建立存款保險制度，運用存款保險機制對有問題的農村金融機構采取及時監(jiān)測和早期糾正措施，促進農村金融機構規(guī)范健康發(fā)展;二是積極探索和發(fā)展農業(yè)保險和農產品期貨市場，發(fā)揮農產品期貨市場和農業(yè)保險在穩(wěn)定糧食價格、保護農民利益方面的功能和作用。三是進一步加快信用環(huán)境建設，增強信用機構與農民之間的信息溝通，建立分散信貸風險的機制，減少信息成本或者降低交易費用，減少金融機構的風險。

       農村金融機構應改變過去產權不清晰、法人治理結構不完善、缺乏有效激勵機制等突出問題。農村信用社是目前我國農村金融組織的主體，是農村金融的主力軍，改革和完善農村金融組織體系，首先應從農村信用社改革開始，在堅持股份制改革大方向的前提下，因地制宜，分步實施，采取符合當地特點的具體組織形式，把地方性、股份制農村商業(yè)銀行作為我國農村信用社發(fā)展的目標模式。根據激勵相容的制度安排，地方政府應把農村信用社看作當地農村經濟發(fā)展的重要因素，允許地方財政代表地方政府入股，用優(yōu)惠政策支持信用社化解支付風險。從農業(yè)銀行的比較優(yōu)勢來看，其優(yōu)勢不在城市而在農村，其核心競爭力的培育也應該在農村。農業(yè)銀行應加強縣以下機構建設，提高對農村金融市場的影響力，在農村金融市場上通過資金優(yōu)勢、網點優(yōu)勢、隊伍優(yōu)勢和技術優(yōu)勢為“三農”服務。在此基礎上，政府相關部門應適當放松金融市場準入制度，允許民間資本進入金融領域，優(yōu)化農村金融結構，特別是要鼓勵和支持發(fā)展適合農村需求特點的多種所有制的金融組織，大力培養(yǎng)多種形式的小額信貸組織;積極穩(wěn)妥地推進利率市場化，進一步擴大存貸款利率浮動范圍，充分調動農村金融組織向“三農”投資的積極性。

       農村金融結構是我國金融改革發(fā)展的一個新課題，農村經濟的發(fā)展需要國家進一步強化農村金融機構發(fā)展的經濟政策。農村金融機構是服務于農村經濟的金融主力，根據服務對象的多層次性和金融機構自身發(fā)展的差異性決定其經營上的多樣性。在經營中提供各自特有的金融服務，在此基礎上發(fā)展成分布廣、經營靈活、市場敏感度強的金融機構。在市場定位過程中，農村金融機構要樹立正確的經營指導思想，找準服務方向，調整資產負債結構，樹立適度規(guī)模經營、穩(wěn)健有效發(fā)展的指導思想，加大對養(yǎng)殖業(yè)、農業(yè)產業(yè)化和優(yōu)質特色農業(yè)的支持力度。要促進縣域經濟發(fā)展和金融機構適度競爭，允許社會資金參與現(xiàn)有金融機構重組和參股新設農村金融機構，推動交易工具和業(yè)務品種的創(chuàng)新，探索更適合中國國情的農村金融組織形式。應以市場配置的方式，從外延、內涵上積極拓展空間，根據自身特點，開展農村金融創(chuàng)新活動，以吸引和方便客戶。一方面，擴大傳統(tǒng)業(yè)務規(guī)模，更新觀念，改變以往經營方式，做到“人無我有、以特取勝”;另一方面，要增加業(yè)務品種，走出傳統(tǒng)業(yè)務的狹小范圍，在積極擴大資產與負債業(yè)務創(chuàng)新的同時，抓住中間業(yè)務的開拓和發(fā)展，使之成為新的效益增長點。農村金融機構還應完善經營規(guī)則，積極發(fā)展農民個人消費信貸，利用農村金融機構擅長經營零售業(yè)務的優(yōu)勢，把經營觸角拓展到農民消費這塊金融服務的新領域。

       長期以來，金融監(jiān)管及其體系建設是我國的一個薄弱環(huán)節(jié)，其中農村金融監(jiān)管更加薄弱。目前，我國金融僅有中央監(jiān)管系統(tǒng)，地方缺乏積極性。因此，要建立以中央銀行和金融監(jiān)管部門為主導、以地方政府為主體的農村金融監(jiān)管體系。地方政府要進一步加強與中央銀行和金融監(jiān)管部門的溝通協(xié)調，加強功能監(jiān)管、審慎監(jiān)管，完善市場信息披露制度，努力防范各種金融風險。建立農村金融事務協(xié)調機制，充分利用地方政府與金融監(jiān)管機構在有關農村經濟發(fā)展與金融部門信息方面各自擁有的比較優(yōu)勢，通過交流以便利決策，在金融危機處理與金融風險化解方面采取協(xié)調行動，將已發(fā)生的損失及其負面影響降到最低限度。